宅基地使用权纠纷主要包括以下几种：宅基地使用权转让纠纷、宅基地使用权使用纠纷、宅基地使用权侵权纠纷、宅基地使用权继承纠纷、宅基地使用权消灭纠纷等。宅基地使用权是农村集体所有土地用以建设用途的主要方面，与土地承包经营权一样也是农民安身立命的重要权利形态。因此，《规定》将宅基地使用权纠纷列为用益物权纠纷项下的第案由，凡是因宅基地使用权产生的纠纷，可以直接适用本案由。
宅基地使用权纠纷怎么解决？人民法院受理民事案件有一定的主管范围，超出主管范围，人民法院即没有审判权。《中华人民共和国土地管理法》第十六条第1款规定，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决;协商不成的，由人民政府处理。
宅基地使用权发生争议如何处理？原告秦某、被告向某系邻居，原告的西面与被告的东面相邻。原、被告都持有宅基地使用权证。原告持有的土地使用证载明：东与财经所相邻、借财经所列；西与向某共列；南与彭某相邻自列；北邻街道。被告持有的建房土地使用证载明：东全列；西全列；南全列；北全列。2009年2月，原告翻修新房，在翻修过程中，被告以原告建房侵占了自己的宅基地面积为由，与原告发生纠纷。故原告诉请法院判决二被告停止侵害、排除妨碍。法院审理后认为，原、被告东西相邻，均对各自的宅基地使用权持有合法的依据，双方所发生的争议源于宅基地使用权证的东西界线不清，原告以侵权行为提起诉讼，实质是宅基地使用权纠纷，应依法由人民政府处理，在调解无效后，遂作出裁定驳回秦某的起诉。
根据《土地管理法》第十六条第三款的规定，如果当事人一方或双方对人民政府的处理决定不服，可以依照《中华人民共和国行政复议法》的规定申请行政复议，当事人对行政复议决定不服的，可以依法向人民法院提起行政诉讼，或者在收到人民政府的处理决定通知之日起三十日内，直接向人民法院提起行政诉讼，在宅基地使用权争议解决前，任何一方或双方都不能擅自改变争议土地的现状，享有权属依据的一方当事人未经人民政府确权，不能以对方当事人侵权向人民法院起诉，人民法院也不能直接处理。如果双方当事人对宅基地权属都没有什么争议，享有宅基地权属依据的一方当事人认为对方侵犯了自己宅基地权属，可以不经行政机关的处理，直接向人民法院起诉的，人民法院应作为侵权民事案件处理。人民法院受理民事案件有一定的主管范围，超出主管范围，人民法院即没有审判权。《中华人民共和国土地管理法》第十六条第1款规定，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决，协商不成的，由人民政府处理。
一母亲两个儿子，二十几年前以大儿子的名义申请的宅基地，盖了3间房，当时的审批手续已经找不到了，也没有权属证，后来大儿子结婚*转走且转成居民，宅基地上*是母亲和小儿子，小儿子外出5年，母亲一直大儿子养着，3年前老房坍塌，大儿子在宅基地上从新盖了三间房，小儿子听说要拆迁，回来主张宅基地使用权是小儿子的，请问这种情况使用权到底归谁？如果是大儿子的，小儿子想在空地上在盖几间房，大儿子是否可以阻止？如果是小儿子的，新盖的三间房算什么？1..土地管理法62条规定，一户村民只有一处宅基地；即宅基地使用权归该户村民所有．大儿子的*迁出后，宅基地使用权由母亲和小儿子共有．2..根据物权法97条规定，对共有不动产进行处分或作重大修缮的，应当经占份额2/3的全体共同共有人同意．因此，未经小儿子的同意是不能在地上盖新房的．但母亲由其赡养，房子年久坍塌，若小儿子外出无音信，大儿子在地上新盖房子，并无不妥．3..虽然大儿子出资建房，但其*不在村里，故其对房不能拥有产权．对房屋的权属，兄弟二人可协商处理．可约定三间房归母亲和小儿子所有，由小儿子对其兄作适当补偿；或其他方式．
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